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### Running command:
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###   /home/biocbuild/bbs-3.22-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data --md5 scds
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* checking for file ‘scds/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘scds’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... ERROR
--- re-building ‘scds.Rmd’ using rmarkdown

Quitting from scds.Rmd:87-97 [scds]
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
<error/rlang_error>
Error in `xgboost()`:
! argument "y" is missing, with no default
---
Backtrace:
    ▆
 1. └─scds::bcds(sce, retRes = TRUE, verb = TRUE)
 2.   └─xgboost::xgboost(...)
 3.     └─xgboost:::process.y.margin.and.objective(...)
 4.       └─base::NROW(y)
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

Error: processing vignette 'scds.Rmd' failed with diagnostics:
argument "y" is missing, with no default
--- failed re-building ‘scds.Rmd’

SUMMARY: processing the following file failed:
  ‘scds.Rmd’

Error: Vignette re-building failed.
Execution halted