############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r missMethyl -R && F:\biocbuild\bbs-3.22-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data missMethyl ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'missMethyl/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'missMethyl': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'missMethyl.Rmd' using rmarkdown Quitting from missMethyl.Rmd:920-923 [goregion1] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `seqlevelsStyle(regions) <- "UCSC"`: ! could not find function "seqlevelsStyle<-" --- Backtrace: ▆ 1. └─missMethyl::goregion(...) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'missMethyl.Rmd' failed with diagnostics: could not find function "seqlevelsStyle<-" --- failed re-building 'missMethyl.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'missMethyl.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted