############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.22-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data excluderanges ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘excluderanges/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘excluderanges’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘excluderanges.Rmd’ using rmarkdown Quitting from excluderanges.Rmd:401-421 [unnamed-chunk-9] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `.find_start_end_cols()`: ! cannnot determine start/end columns --- Backtrace: ▆ 1. └─GenomicRanges::makeGRangesFromDataFrame(...) 2. └─GenomicRanges:::.find_GRanges_cols(...) 3. └─GenomicRanges:::.find_start_end_cols(...) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'excluderanges.Rmd' failed with diagnostics: cannnot determine start/end columns --- failed re-building ‘excluderanges.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘excluderanges.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted