############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r icetea -R && F:\biocbuild\bbs-3.22-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data icetea ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'icetea/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'icetea': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'mapcap_analysis.Rmd' using rmarkdown Quitting from mapcap_analysis.Rmd:249-259 [plotPrecision] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `seqlevelsStyle(TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm6.ensGene) <- "ENSEMBL"`: ! could not find function "seqlevelsStyle<-" ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'mapcap_analysis.Rmd' failed with diagnostics: could not find function "seqlevelsStyle<-" --- failed re-building 'mapcap_analysis.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'mapcap_analysis.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted