############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data clusterExperiment ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘clusterExperiment/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘clusterExperiment’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes ----------------------------------- ERROR: dependencies ‘NMF’, ‘RColorBrewer’, ‘ape’, ‘limma’, ‘locfdr’, ‘BiocSingular’, ‘kernlab’, ‘edgeR’, ‘scales’, ‘zinbwave’, ‘phylobase’, ‘pracma’, ‘mbkmeans’ are not available for package ‘clusterExperiment’ Perhaps try a variation of: install.packages(c('NMF', 'RColorBrewer', 'ape', 'limma', 'locfdr', 'BiocSingular', 'kernlab', 'edgeR', 'scales', 'zinbwave', 'phylobase', 'pracma', 'mbkmeans')) * removing ‘/private/tmp/RtmpcJ6FrJ/Rinst120ea296dd991/clusterExperiment’ ----------------------------------- ERROR: package installation failed