##############################################################################
##############################################################################
###
### Running command:
###
###   /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD INSTALL affycoretools
###
##############################################################################
##############################################################################


* installing to library ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.5-x86_64/Resources/library’
ERROR: dependencies ‘limma’, ‘ggplot2’, ‘gplots’, ‘oligoClasses’, ‘ReportingTools’, ‘hwriter’, ‘edgeR’, ‘Glimma’ are not available for package ‘affycoretools’
Perhaps try a variation of:
install.packages(c('limma', 'ggplot2', 'gplots', 'oligoClasses', 'ReportingTools', 'hwriter', 'edgeR', 'Glimma'))
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.5-x86_64/Resources/library/affycoretools’