##############################################################################
##############################################################################
###
### Running command:
###
###   /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD INSTALL TPP
###
##############################################################################
##############################################################################


* installing to library ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.5-x86_64/Resources/library’
ERROR: dependencies ‘biobroom’, ‘broom’, ‘data.table’, ‘doParallel’, ‘foreach’, ‘ggplot2’, ‘gridExtra’, ‘limma’, ‘mefa’, ‘nls2’, ‘openxlsx’, ‘plyr’, ‘RColorBrewer’, ‘reshape2’, ‘VennDiagram’, ‘VGAM’ are not available for package ‘TPP’
Perhaps try a variation of:
install.packages(c('biobroom', 'broom', 'data.table', 'doParallel', 'foreach', 'ggplot2', 'gridExtra', 'limma', 'mefa', 'nls2', 'openxlsx', 'plyr', 'RColorBrewer', 'reshape2', 'VennDiagram', 'VGAM'))
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.5-x86_64/Resources/library/TPP’