##############################################################################
##############################################################################
###
### Running command:
###
###   /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD INSTALL PDATK
###
##############################################################################
##############################################################################


* installing to library ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.5-x86_64/Resources/library’
ERROR: dependencies ‘data.table’, ‘ggplotify’, ‘RColorBrewer’, ‘clusterRepro’, ‘CoreGx’, ‘caret’, ‘survminer’, ‘plyr’, ‘piano’, ‘scales’, ‘survcomp’, ‘genefu’, ‘ggplot2’, ‘switchBox’, ‘reportROC’, ‘pROC’, ‘verification’ are not available for package ‘PDATK’
Perhaps try a variation of:
install.packages(c('data.table', 'ggplotify', 'RColorBrewer', 'clusterRepro', 'CoreGx', 'caret', 'survminer', 'plyr', 'piano', 'scales', 'survcomp', 'genefu', 'ggplot2', 'switchBox', 'reportROC', 'pROC', 'verification'))
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.5-x86_64/Resources/library/PDATK’