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### Running command:
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###   /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD INSTALL MSstatsLiP
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* installing to library ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.5-x86_64/Resources/library’
ERROR: dependencies ‘gridExtra’, ‘ggplot2’, ‘MSstats’, ‘MSstatsConvert’, ‘data.table’, ‘MSstatsPTM’, ‘checkmate’, ‘factoextra’, ‘ggpubr’, ‘tidyverse’, ‘scales’, ‘plotly’ are not available for package ‘MSstatsLiP’
Perhaps try a variation of:
install.packages(c('gridExtra', 'ggplot2', 'MSstats', 'MSstatsConvert', 'data.table', 'MSstatsPTM', 'checkmate', 'factoextra', 'ggpubr', 'tidyverse', 'scales', 'plotly'))
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.5-x86_64/Resources/library/MSstatsLiP’