############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data methylPipe ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘methylPipe/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘methylPipe’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘methylPipe.rnw’ using knitr Quitting from methylPipe.rnw:104-107 [mpload] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `library()`: ! there is no package called 'BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18' --- Backtrace: x 1. \-base::library(BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'methylPipe.rnw' failed with diagnostics: there is no package called 'BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18' --- failed re-building ‘methylPipe.rnw’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘methylPipe.rnw’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted