############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data PIUMA ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘PIUMA/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘PIUMA’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘PIUMA_vignette.Rmd’ using rmarkdown Quitting from PIUMA_vignette.Rmd:375-383 [chunk-8] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ NULL ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'PIUMA_vignette.Rmd' failed with diagnostics: Cannot create a graph object because the adjacency matrix contains NAs. --- failed re-building ‘PIUMA_vignette.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘PIUMA_vignette.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted