############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data Rcollectl ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘Rcollectl/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘Rcollectl’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘Rcollectl.Rmd’ using rmarkdown Quitting from Rcollectl.Rmd:114-136 [lkts] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `proc$process$interrupt`: ! $ operator is invalid for atomic vectors --- Backtrace: ▆ 1. └─Rcollectl::cl_stop(id) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'Rcollectl.Rmd' failed with diagnostics: $ operator is invalid for atomic vectors --- failed re-building ‘Rcollectl.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘Rcollectl.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted